RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299240.10

TTC17-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC17, Length 3,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-202ENST00000299240 IGDCC3Q8IVU1 814 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 NPWQ8N729 165 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 BADQ92934 168 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 FTHL17Q9BXU8 183 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 SLC13A1Q9BZW2 595 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CCL22O00626 93 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TLR5O60602 858 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 MAN1A1P33908 653 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 PTK6Q13882 451 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 NOMO1Q15155 1222 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 ALS2CLQ60I27 953 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 ART4Q93070 314 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 P2RY11Q96G91 374 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 ACSS2Q9NR19 701 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 HOMER3Q9NSC5 361 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 MARCH2Q9P0N8 246 aa13.01□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 NDUFAB1O14561 156 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CNTN5O94779 1100 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CPP00450 1065 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 IVDP26440 423 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 RASIP1Q5U651 963 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 PLPP4Q5VZY2 271 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 DENND1CQ8IV53 801 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 NUP93Q8N1F7 819 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 ADAM7Q9H2U9 754 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CNGB3Q9NQW8 809 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 WBP1LQ9NX94 342 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 MTMR10Q9NXD2 777 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 RASA4BC9J798 803 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 RASA4O43374 803 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 GJB5O95377 273 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 LMNB2Q03252 620 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 OASLQ15646 514 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TTC13Q8NBP0 860 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 FBF1Q8TES7 1133 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 FNIP1Q8TF40 1166 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 EPAS1Q99814 870 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 MARCH5Q9NX47 278 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 ANK1P16157 1881 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CHD9Q3L8U1 2897 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 A0A0U1RQS6 177 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 WDR27A2RRH5 827 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 UGT1A9O60656 530 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 LRRC38Q5VT99 294 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TPGS1Q6ZTW0 290 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 SCD5Q86SK9 330 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 SLC35B2Q8TB61 432 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 KCNN1Q92952 543 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 UGT1A7Q9HAW7 530 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 UGT1A10Q9HAW8 530 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 UGT1A8Q9HAW9 530 aa13□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 VAV1P15498 845 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 ARL4CP56559 192 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 SLMAPQ14BN4 828 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CLUL1Q15846 466 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CCDC63Q8NA47 563 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 NAT14Q8WUY8 206 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 HTR3CQ8WXA8 447 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 NPY6RQ99463 290 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 MTMR11A4FU01 709 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 A8MX80 341 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 ATP8B1O43520 1251 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 GJB3O75712 270 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CDK7P50613 346 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TBX4P57082 545 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TMPRSS15P98073 1019 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 NECAB2Q7Z6G3 386 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 NIPA2Q8N8Q9 360 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 KLC2Q9H0B6 622 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 C11orf49Q9H6J7 331 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 DSEQ9UL01 958 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 FZD10Q9ULW2 581 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 ATP8B3O60423 1300 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TTC4O95801 387 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CKMP06732 381 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 MYL4P12829 197 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 SEMG2Q02383 582 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 TXNDC8Q6A555 127 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 OR6K2Q8NGY2 324 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 CCDC77Q9BR77 488 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC17-202ENST00000299240 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms