RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC39A13Q96H72 371 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C5orf42Q9H799 3197 aa24.71■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.71■■□□□ 1.55
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPN7P35236 360 aa24.71■■□□□ 1.55
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUPD1Q68J44 220 aa24.71■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM118BQ9BPY3 351 aa24.71■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.71■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 APOL5Q9BWW9 433 aa24.71■■□□□ 1.55
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDH22Q9UJ99 828 aa24.71■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TLR6Q9Y2C9 796 aa24.71■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DAPK3O43293 454 aa24.7■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNQ1P51787 676 aa24.7■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DRG2P55039 364 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.55
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC5A9Q2M3M2 681 aa24.7■■□□□ 1.55
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.7■■□□□ 1.55
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WBP2Q969T9 261 aa24.7■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NTAN1Q96AB6 310 aa24.7■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATXN3LQ9H3M9 355 aa24.7■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.7■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNMT3LQ9UJW3 386 aa24.7■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XIRP2A4UGR9 3374 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C1RP00736 705 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RHOP08100 348 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HOXA9P31269 272 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCR1P32246 355 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DYNLT1P63172 113 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRIN2CQ14957 1233 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRKD2Q9BZL6 878 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCLK3Q9C098 648 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZXDBP98169 803 aa24.69■■□□□ 1.54
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFHC2Q5JST6 749 aa24.69■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAB21L3Q8N8X9 362 aa24.69■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SHKBP1Q8TBC3 707 aa24.69■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIK2Q9H0K1 926 aa24.69■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa24.69■■□□□ 1.54
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAGE1O75459 146 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TJP3O95049 919 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ECHS1P30084 290 aa24.68■■□□□ 1.54
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCNG2Q16589 344 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM153CQ494X1 144 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM71BQ8TC56 605 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HAUS1Q96CS2 278 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DPH5Q9H2P9 285 aa24.68■■□□□ 1.54
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGLV3-27P01718 113 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IRF1P10914 325 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNJ1P48048 391 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUBP50607 506 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPS2Q13227 327 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POTEHQ6S545 545 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RTL10Q7L3V2 364 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RFX6Q8HWS3 928 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF276Q8N554 614 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM161BQ96MY7 647 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C2orf16Q68DN1 1984 aa24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
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