RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MCFD2Q8NI22 146 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RNFT2Q96EX2 444 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 EHD1Q9H4M9 534 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PLK2Q9NYY3 685 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RNF181Q9P0P0 153 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TDP2O95551 362 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FLT3P36888 993 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SPON1Q9HCB6 807 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PRKD3O94806 890 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF24P17028 368 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HK2P52789 917 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SLC25A3Q00325 362 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ACVR2BQ13705 512 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 LPCAT4Q643R3 524 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 BICRALQ6AI39 1079 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FAR1Q8WVX9 515 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MNTQ99583 582 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 EMSYQ7Z589 1322 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KCNN4O15554 427 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HSD17B4P51659 736 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 DGCR6Q14129 220 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MYBPC3Q14896 1274 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CARTPTQ16568 116 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TTC23LQ6PF05 361 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 COMMD8Q9NX08 183 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PHF24Q9UPV7 400 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HPSEQ9Y251 543 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SLIT1O75093 1534 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MAGEB16A2A368 324 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MAGEC1O60732 1142 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 NDUFB10O96000 172 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ENPEPQ07075 957 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 Q3C1V9 767 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ILVBLA1L0T0 632 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SERPINE1P05121 402 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CACNB3P54284 484 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 IER5Q5VY09 327 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 STK32CQ86UX6 486 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 EID3Q8N140 333 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 MTMR8Q96EF0 704 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SLC1A6P48664 564 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HPS4Q9NQG7 708 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 FBP2O00757 339 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 APOL3O95236 402 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ITGA4P13612 1032 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PNPLA4P41247 253 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 HALP42357 657 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 SNX32Q86XE0 403 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC42Q9Y546 428 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PRKAR1AP10644 381 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 STARP49675 285 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms