RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270722.9

PRDM16-201, Transcript of PR/SET domain 16, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM16, Length 8,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRDM16-201ENST00000270722 GIT1Q9Y2X7 761 aa13.55□□□□□ -0.24
PRDM16-201ENST00000270722 NOTOA8MTQ0 251 aa13.55□□□□□ -0.24
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PRDM16-201ENST00000270722 ZNF618Q5T7W0 954 aa13.55□□□□□ -0.24
PRDM16-201ENST00000270722 LRIG3Q6UXM1 1119 aa13.55□□□□□ -0.24
PRDM16-201ENST00000270722 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
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