RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269844.4

PRDM15-201, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM15, Length 4,881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-201ENST00000269844 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 GLRBP48167 497 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 GRM4Q14833 912 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 ASB12Q8WXK4 309 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 VPS33AQ96AX1 596 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 MLXQ9UH92 298 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 A0A0G2JPF8 293 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 E7ENX8 843 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TOR1BO14657 336 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 MT-CO1P00395 513 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PRKAA1Q13131 559 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PWWP2AQ96N64 755 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 A0A1W2PPM1 405 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 KBTBD13C9JR72 458 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 KLHL18O94889 574 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 SGPL1O95470 568 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 CCNE2O96020 404 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 GZMAP12544 262 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 SCARF1Q14162 830 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 KRT84Q9NSB2 600 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 IL6P05231 212 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 CREB1P16220 341 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 ECT2LQ008S8 904 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RELAQ04206 551 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 SLC1A5Q15758 541 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RSAD1Q9HA92 442 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 ATP7AQ04656 1500 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 USP17L15C9J2P7 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 USP17L11C9JVI0 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 USP17L18D6R9N7 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 USP17L22D6RA61 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 USP17L19D6RCP7 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 USP17L20D6RJB6 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 ATG7O95352 703 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PSME3P61289 254 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RHAGQ02094 409 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 USP17L24Q0WX57 530 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 EID3Q8N140 333 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 HGH1Q9BTY7 390 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 OSTNP61366 133 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PLCL1Q15111 1095 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 EXD1Q8NHP7 514 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 GNB5O14775 395 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TMCC2O75069 709 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RRM1P23921 792 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TUBP50607 506 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 PON2Q15165 354 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TSC22D1Q15714 1073 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 C2CD6Q53TS8 623 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 OGFOD2Q6N063 350 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 COMMD8Q9NX08 183 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 GTF2H1P32780 548 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 RAB25P57735 213 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 TRIM32Q13049 653 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 HERC3Q15034 1050 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM15-201ENST00000269844 NCF4Q15080 339 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms