RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 HAPLN3Q96S86 360 aa23.41■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 NINJ2Q9NZG7 142 aa23.41■■□□□ 1.34
RNF170-201ENST00000240159 LRIG2O94898 1065 aa23.4■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 NETO2Q8NC67 525 aa23.4■■□□□ 1.34
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RNF170-201ENST00000240159 TBX18O95935 607 aa23.36■■□□□ 1.33
RNF170-201ENST00000240159 TBX4P57082 545 aa23.36■■□□□ 1.33
RNF170-201ENST00000240159 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RNF170-201ENST00000240159 CCNYQ8ND76 341 aa23.36■■□□□ 1.33
RNF170-201ENST00000240159 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.36■■□□□ 1.33
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RNF170-201ENST00000240159 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RNF170-201ENST00000240159 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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