RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc19Q8BZT5 364 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trps1Q925H1 1281 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Micu3Q9CTY5 523 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Satl1Q9D5N8 744 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem174Q9DCX7 243 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tagln3Q9R1Q8 199 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nrf1Q9WU00 503 aa16.5■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SprtnG3X912 497 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Timm44O35857 452 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ceacam5Q3UKK2 947 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl2Q8JZP3 593 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hkdc1Q91W97 915 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim7Q923T7 510 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcyox1Q9CQF9 505 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mettl7bQ9DD20 244 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpinb9O08797 374 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim75Q3UWZ0 467 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grid2Q61625 1007 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mbtd1Q6P5G3 631 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fnip2Q80TD3 1108 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem260Q8BMD6 703 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8BZE1 841 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hectd2Q8CDU6 774 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ablim1Q8K4G5 861 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myoz3Q8R4E4 245 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Poc5Q9DBS8 558 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acox2Q9QXD1 681 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r59E9PUT5 865 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Traf3Q60803 567 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zdhhc3Q8R173 299 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HnmtQ91VF2 295 aa16.49■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7694J3QNH8 270 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psmb4P99026 264 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myo1gQ5SUA5 1024 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc9a4Q8BUE1 797 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RalbQ9JIW9 206 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp21Q9QZL6 566 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TfebQ9R210 475 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NinQ61043 2035 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcdc2bF7BCK0 340 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lhx5P61375 402 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RgnQ64374 299 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc24Q8BHA1 521 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SybuQ8BHS8 665 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Katnal2Q9D3R6 539 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Doc2gQ9ESN1 387 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MycsQ9Z304 431 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scn1aA2APX8 2009 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sbf2E9PXF8 1872 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr271-ps1A0A1L1SQH2 283 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7086A0A1W2P766 342 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Armt1A6H630 439 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17535J3KMR8 224 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eno3P21550 434 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 StamP70297 548 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcnx4Q3UVY5 1174 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rcsd1Q3UZA1 412 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Papss1Q60967 624 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ItpkcQ7TS72 678 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Frmd4bQ920B0 1035 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stk33Q924X7 491 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ecrg4Q99LS0 148 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vta1Q9CR26 309 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MrgbpQ9DAT2 204 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tle6Q9WVB3 581 aa16.48■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10722F6VLK5 217 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp946F6VWU8 523 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cspg5Q71M36 566 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr798Q7TRH8 311 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Qsox1Q8BND5 748 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NaprtQ8CC86 538 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Angel2Q8K1C0 544 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dok4Q99KE3 325 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mcrs1Q99L90 462 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grk2Q99MK8 689 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam3aQ9D8T0 230 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfrsf11bO08712 401 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acot1O55137 419 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prl3b1P09586 222 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BpgmP15327 259 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lmo2P25801 158 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GsrP47791 500 aa16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Matn1P51942 500 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mettl17Q3U2U7 461 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.1 ms