RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	E2F6	O75461	281 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TRPA1	O75762	1119 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CD4	P01730	458 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	HMGCR	P04035	888 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ADCY8	P40145	1251 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	KCNJ1	P48048	391 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CD97	P48960	835 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ORC1	Q13415	861 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CENPU	Q71F23	418 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC6	Q86X45	466 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PDSS2	Q86YH6	399 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	BTBD9	Q96Q07	612 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	HEY2	Q9UBP5	337 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		15.83	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PPEF2	O14830	753 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TM7SF2	O76062	418 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	NDST1	P52848	882 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SPOCK2	Q92563	424 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	WNT8B	Q93098	351 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CCNF	P41002	786 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEA4	P43358	317 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CHN2	P52757	468 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SPIDR	Q14159	915 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RINL	Q6ZS11	566 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RASSF3	Q86WH2	238 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	FAM161B	Q96MY7	647 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RNF19A	Q9NV58	838 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		15.82	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PIR	O00625	290 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MICAL2	O94851	1124 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CHRNA1	P02708	482 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CTSH	P09668	335 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CYP3A5	P20815	502 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	APLP1	P51693	650 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PLCB3	Q01970	1234 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TAP1	Q03518	808 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MGAT3	Q09327	533 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	BORA	Q6PGQ7	559 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	JADE3	Q92613	823 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf21	Q9H246	121 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CHST12	Q9NRB3	414 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	DMTF1	Q9Y222	760 aa		15.81	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ETS2	P15036	469 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CDK18	Q07002	472 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CHSY1	Q86X52	802 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	NUP93	Q8N1F7	819 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RAET1E	Q8TD07	263 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF560	Q96MR9	790 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SCN1A	P35498	2009 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659		M0QYV0	167 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PEX1	O43933	1283 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PNPLA4	P41247	253 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MPP3	Q13368	585 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	STIL	Q15468	1287 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SLC1A5	Q15758	541 aa		15.8	■□□□□ 0.12

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