RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 FZD9O00144 591 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC11A2P49281 568 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KIZQ2M2Z5 673 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CDH19Q9H159 772 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 FLT3LGP49771 235 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 PRKCQQ04759 706 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GRIK4Q16099 956 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.47□□□□□ -1.37
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