RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ASB7	Q9H672	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	DERA	Q9Y315	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BRCA2	P51587	3418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PTGES	O14684	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	INPPL1	O15357	1258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	AKAP3	O75969	853 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	B3GAT3	O94766	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	RASGRP1	O95267	797 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	KRT1	P04264	644 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ALDH2	P05091	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ADRB2	P07550	413 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	KRT19	P08727	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MYOG	P15173	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	KCNE1	P15382	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CYP3A5	P20815	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GLDC	P23378	1020 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CTNNB1	P35222	781 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	OR1G1	P47890	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CASP4	P49662	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CDR1	P51861	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	AP3M2	P53677	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BCAR1	P56945	870 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	KRT17	Q04695	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SPAG1	Q07617	926 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	DSC1	Q08554	894 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CETN1	Q12798	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BFSP1	Q12934	665 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BIRC3	Q13489	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TRPC3	Q13507	836 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PSMD6	Q15008	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SYCP1	Q15431	976 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF124	Q15973	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	UROC1	Q96N76	676 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms