RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528066.1

RCOR3-209, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 3

Gene RCOR3, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-209	ENST00000528066	HTR1B	P28222	390 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	SOX8	P57073	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	RAB1A	P62820	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	DOCK2	Q92608	1830 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	DOCK1	Q14185	1865 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066		A0A0B4J269	797 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066		F5H697	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066		M0QYG6	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	SOAT2	O75908	522 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	CHRM3	P20309	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	NDUFV1	P49821	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	HMGCS2	P54868	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	NHLH1	Q02575	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	TUBB3	Q13509	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	FGL2	Q14314	439 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	PTPRR	Q15256	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	USP6NL	Q92738	828 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	RLF	Q13129	1914 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	NCOR1	O75376	2440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	GRM8	O00222	908 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	TRIAP1	O43715	76 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	TUSC2	O75896	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	PDE8B	O95263	885 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	C1R	P00736	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	PTMS	P20962	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	ITGB8	P26012	769 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	NXPH1	P58417	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	ITIH3	Q06033	890 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	KAZN	Q674X7	775 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	NELL1	Q92832	810 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-209	ENST00000528066	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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