RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526386.5

UBASH3B-203, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-203ENST00000526386 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM72BQ86X60 149 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ARHGAP18Q8N392 663 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM199Q8N511 208 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ARL8AQ96BM9 186 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC39A13Q96H72 371 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF558Q96NG5 402 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 HAPLN3Q96S86 360 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 DTLQ9NZJ0 730 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 NEU3Q9UQ49 428 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 PLAAQ9Y263 795 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 RAD54BQ9Y620 910 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 PLXNA3P51805 1871 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 WDR27A2RRH5 827 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 H7C0C1 242 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SGK1O00141 431 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ALOX15BO15296 676 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 OPA1O60313 960 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 GCATO75600 419 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 TCEA3O75764 348 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 IGLV3-27P01718 113 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 LINC00271P0C7V0 271 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 RAG1P15918 1043 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 LAG3P18627 525 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 YWHAQP27348 245 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ATP5OP48047 213 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 VPS41P49754 854 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 PSEN1P49768 467 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 PMS2P54278 862 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 CBX1P83916 185 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF844Q08AG5 666 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 DUSP4Q13115 394 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 RAB33AQ14088 237 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 P3H1Q32P28 736 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 TPGS2Q68CL5 300 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 C4orf22Q6V702 233 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 RFX8Q6ZV50 586 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 PCGF5Q86SE9 256 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 HOOK3Q86VS8 718 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ADAM32Q8TC27 787 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 CPT1BQ92523 772 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 CASP10Q92851 521 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 KLC2Q9H0B6 622 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 WDCPQ9H6R7 721 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SPG21Q9NZD8 308 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 GMIPQ9P107 970 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC38A8A6NNN8 435 aa7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 WASH4PA8MWX3 477 aa7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 E7ESA3 106 aa7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 RIPK2O43353 540 aa7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 RNF40O75150 1001 aa7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-203ENST00000526386 SOAT2O75908 522 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms