RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159		C9IYK1	514 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SGTA	O43765	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	DNAJB5	O75953	348 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLITRK5	O94991	958 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MYL4	P12829	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SCG2	P13521	617 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	BDNF	P23560	247 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCNC	P24863	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CD6	P30203	668 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	AXL	P30530	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	DDOST	P39656	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CASP3	P42574	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCNC1	P48547	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	IKBKE	Q14164	716 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SGCD	Q92629	289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	APBB2	Q92870	758 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	DRC3	Q9H069	523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159		B4E1Z4	1266 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159		H0Y626	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CYP26A1	O43174	497 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATG13	O75143	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UGT2B11	O75310	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	RFPL1	O75677	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MATN1	P21941	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PRKACB	P22694	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF76	P36508	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTPN9	P43378	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MGAT3	Q09327	533 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TTL	Q8NG68	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	RAD54L	Q92698	747 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TAMM41	Q96BW9	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TNKS	O95271	1327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CLPX	O76031	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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