RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	BICD2	Q8TD16	824 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	SNX33	Q8WV41	574 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM167A	Q96KS9	214 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF302	Q9NR11	478 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	RGS18	Q9NS28	235 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	SCOC	Q9UIL1	159 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	MYO7A	Q13402	2215 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PDE4D-222	ENST00000514552	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		7.59	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1W2PRX2	142 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	DENND3	A2RUS2	1198 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	SMCO2	A6NFE2	343 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PATE3	B3GLJ2	98 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM86B1	E9PN63	330 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552		K7ESM1	405 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	MAGEB2	O15479	319 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PRAMEF4	O60810	478 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PHF2	O75151	1096 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	C22orf31	O95567	290 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CCNE2	O96020	404 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	KLRC1	P26715	233 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	GNA11	P29992	359 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CIITA	P33076	1130 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PPM1A	P35813	382 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFV1	P49821	464 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	7.58	□□□□□ -1.2	4e-7	■■■■■ 39.1
PDE4D-222	ENST00000514552	PTPN21	Q16825	1174 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	POF1B	Q8WVV4	589 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	JADE3	Q92613	823 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PRRX2	Q99811	253 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	C6orf50	Q9HD87	102 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	TLR9	Q9NR96	1032 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	FOXS1	O43638	330 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHGA12	O60330	932 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	GLP2R	O95838	553 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	LAG3	P18627	525 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAJB1	P25685	340 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM189B	P81408	668 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CDC42EP1	Q00587	391 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ACAP2	Q15057	778 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC43	Q8N309	656 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR156	Q8NFN8	814 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	EDA	Q92838	391 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	OR14A2	Q96R54	314 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	RIT2	Q99578	217 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CFAP54	Q96N23	3096 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	UBE2QL1	A1L167	161 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC01565	O15544	149 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	MGEA5	O60502	916 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR32	O75388	356 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	FGF18	O76093	207 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CCND1	P24385	295 aa		7.56	□□□□□ -1.2

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