RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514402.1

MATR3-223, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-223	ENST00000514402	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PRC1	O43663	620 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	SLC8A1	P32418	973 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	CPA2	P48052	419 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ME1	P48163	572 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF84	P51523	738 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	BTK	Q06187	659 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PICALM	Q13492	652 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NRAC	Q8N912	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402		F8W810	466 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PODXL	O00592	558 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NCK2	O43639	380 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TULP3	O75386	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	OAZ2	O95190	189 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NTSR2	O95665	410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	IDUA	P35475	653 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	VPS41	P49754	854 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	DMWD	Q09019	674 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ELF2	Q15723	593 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64	4e-7	■■□□□ 14.4
MATR3-223	ENST00000514402	KAT2B	Q92831	832 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	FAR2	Q96K12	515 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NPC1	O15118	1278 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	INSIG1	O15503	277 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PLA2G6	O60733	806 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	SOX2	P48431	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TBX4	P57082	545 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	MTA1	Q13330	715 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	GAB1	Q13480	694 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	MTX1	Q13505	466 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PIM3	Q86V86	326 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	MYD88	Q99836	296 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NTN1	O95631	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	MYL3	P08590	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ITGA5	P08648	1049 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	AKR1A1	P14550	325 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	STAT6	P42226	847 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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