RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EME1Q96AY2 570 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CGRRF1Q99675 332 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ISCUQ9H1K1 167 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NMRK2Q9NPI5 230 aa4.01□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLSCR5A0PG75 271 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MDM4O15151 490 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CA12O43570 354 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HSPA6P17066 643 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VPS41P49754 854 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EPHB1P54762 984 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGBP1P78318 339 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DSC1Q08554 894 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FGL2Q14314 439 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC6Q16204 474 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CREB3L2Q70SY1 520 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DENND1CQ8IV53 801 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STAG1Q8WVM7 1258 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NODALQ96S42 347 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SENP7Q9BQF6 1050 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTLL2Q9BWV7 592 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM54Q9BYV2 358 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VPS45Q9NRW7 570 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CKAP5Q14008 2032 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCP110O43303 1012 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AP1G1O43747 822 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RFPL1O75677 317 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GLUD1P00367 558 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LDLRP01130 860 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FCGR1AP12314 374 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NCLP19338 710 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GLUD2P49448 558 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PDLIM4P50479 330 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARFIP2P53365 341 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RAB1AP62820 205 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC13A2Q13183 592 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 Q6ZTK2 550 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLBD2Q8NHP8 589 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RTP4Q96DX8 246 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DUX5Q96PT3 197 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF180Q9UJW8 692 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa3.99□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DPPA5A6NC42 116 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTC34A8MYJ7 566 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM233B4DJY2 109 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 INAFM1C9JVW0 142 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CYP1A2P05177 515 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HTR1BP28222 390 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SOX2P48431 317 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RAB27AP51159 221 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 B3GNT9Q6UX72 402 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC35G2Q8TBE7 412 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDH19Q9H159 772 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.98□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GAGE12JA6NER3 117 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AGPSO00116 658 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPRY3O43610 288 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SNX2O60749 519 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNASE1L3Q13609 305 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNJ12Q14500 433 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZDHHC24Q6UX98 284 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 P3H2Q8IVL5 708 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DDIASQ8IXT1 998 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.97□□□□□ -1.77
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms