RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 PIEZO1Q92508 2521 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM24O15164 1050 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SERPINC1P01008 464 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 IGLV3-27P01718 113 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ARID5AQ03989 594 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 MESP2Q0VG99 397 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 CHPFQ8IZ52 775 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 DEFB106AQ8N104 65 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 EBF1Q9UH73 591 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXO10Q9UK96 956 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ERBB2P04626 1255 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 MMEP08473 750 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 CISD3P0C7P0 127 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 NTSR1P30989 418 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 JAM2P57087 298 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 CDR2Q01850 454 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 MTA1Q13330 715 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TAF5Q15542 800 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TAC4Q86UU9 113 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SFTPA1Q8IWL2 248 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SUMF1Q8NBK3 374 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM51Q9NW97 253 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 DDIT4Q9NX09 232 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 RRN3Q9NYV6 651 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 NPC1O15118 1278 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 HRO43593 1189 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 TIMM44O43615 452 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 GRAP2O75791 330 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCB4P21439 1286 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 CCR1P32246 355 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 NOS2P35228 1153 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 MPP7Q5T2T1 576 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 PGBD3Q8N328 593 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 GAB3Q8WWW8 586 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-210ENST00000505941 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SGK1O00141 431 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 EPHB6O15197 1021 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 GABRB2P47870 512 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PIK3R6Q5UE93 754 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ANO7Q6IWH7 933 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC39A13Q96H72 371 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.099e-6■■■■□ 24.8
SH3BP2-210ENST00000505941 COX16Q9P0S2 106 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PRRT4C9JH25 899 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 TBL1XO60907 577 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 DAB1O75553 588 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 HOXB2P14652 356 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 SCNN1AP37088 669 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 MATKP42679 507 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 NME3Q13232 169 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 NAA35Q5VZE5 725 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 C11orf74Q86VG3 221 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-210ENST00000505941 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms