RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CD248	Q9HCU0	757 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		18.03	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424		M0QYV0	167 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV3-27	P01718	113 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	LTF	P02788	710 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	MPL	P40238	635 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM110	Q86TL2	294 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DENND1C	Q8IV53	801 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	KAT5	Q92993	513 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM51	Q9NW97	253 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	HCN2	Q9UL51	889 aa		18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	18.02	■□□□□ 0.48
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PQF6	199 aa		18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRT4	C9JH25	899 aa		18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXB2	P14652	356 aa		18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	BPIFB4	P59827	614 aa		18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	LUZP1	Q86V48	1076 aa		18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	CHPF	Q8IZ52	775 aa		18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	NEK11	Q8NG66	645 aa		18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	18.01	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GABBR2	O75899	941 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TPM3	P06753	285 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GLI1	P08151	1106 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	LCP1	P13796	627 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC11A2	P49281	568 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX16	P57768	344 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	PTK2	Q05397	1052 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	MTA1	Q13330	715 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SHC3	Q92529	594 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINB11	Q96P15	392 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	LHX5	Q9H2C1	402 aa		18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	18	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SPTBN2	O15020	2390 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	THADA	Q6YHU6	1953 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM24	O15164	1050 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP1A3	P13637	1013 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GBP1	P32455	592 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNMA1	Q12791	1236 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	STARD3	Q14849	445 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SYCP1	Q15431	976 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	DDI1	Q8WTU0	396 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP205	Q92621	2012 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		17.99	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ANTXRL	A6NF34	631 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	TM4SF5	O14894	197 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	DCLK1	O15075	740 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	AP5Z1	O43299	807 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	HMBS	P08397	361 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	UCHL3	P15374	230 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRG2	P18507	467 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	GJB7	Q6PEY0	223 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGB4	Q8WW32	186 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	EDEM1	Q92611	657 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SPAG5	Q96R06	1193 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	STK33	Q9BYT3	514 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	FBRS	Q9HAH7	460 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SIX2	Q9NPC8	291 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		17.98	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K13	O43283	966 aa		17.97	■□□□□ 0.47
HDAC10-216	ENST00000489424	THAP12	O43422	761 aa		17.97	■□□□□ 0.47

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