RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	KPNA5	O15131	536 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	COQ9	O75208	318 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ST6GAL1	P15907	406 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	IDUA	P35475	653 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF543	Q08ER8	600 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	BFSP2	Q13515	415 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	DAG1	Q14118	895 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	CNGA3	Q16281	694 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	RFX8	Q6ZV50	586 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A1W2PPC1	479 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	POM121B	A6NF01	834 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	EPN2	O95208	641 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	DGKQ	P52824	942 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	GPS1	Q13098	491 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	KCNJ12	Q14500	433 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	FAXC	Q5TGI0	409 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM199	Q8N511	208 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM50B	Q9Y247	325 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	PRY	O14603	147 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	AREL1	O15033	823 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	UGDH	O60701	494 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	CBFA2T3	O75081	653 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	ALAD	P13716	330 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	RPS6KB1	P23443	525 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	ARRB2	P32121	409 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	ELF2	Q15723	593 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM57B	Q71RH2	274 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	NR4A3	Q92570	626 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	MEIS3	Q99687	375 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	DECR2	Q9NUI1	292 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	FGFR2	P21802	821 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	DUSP1	P28562	367 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	HOXD12	P35452	270 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	AGTR2	P50052	363 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	P2RX3	P56373	397 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	SEMA3B	Q13214	749 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	P3H1	Q32P28	736 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	RNF152	Q8N8N0	203 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	NEUROG1	Q92886	237 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	MIB2	Q96AX9	1013 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	WDR24	Q96S15	920 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	TBCB	Q99426	244 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
CCNL1-223	ENST00000481173	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	3.76	□□□□□ -1.81

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