RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461522.1

UBA3-204, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, human

TSL 2

Gene UBA3, Length 693 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBA3-204	ENST00000461522	PBX1	P40424	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	MTX1	Q13505	466 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	DIP2B	Q9P265	1576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	AREL1	O15033	823 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	KCNQ3	O43525	872 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	CD63	P08962	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TSPY4	P0CV99	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TSPY10	P0CW01	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	PSG1	P11464	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ATF3	P18847	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	SCP2	P22307	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	YY1	P25490	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	CPA2	P48052	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TTC3	P53804	2025 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	PSMD1	Q99460	953 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	FANCA	O15360	1455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	DUSP1	P28562	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	GPS1	Q13098	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	KIF14	Q15058	1648 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TULP3	O75386	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	FGF2	P09038	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	MST1	P26927	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	SLC5A2	P31639	672 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	CCKBR	P32239	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	IDUA	P35475	653 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	CNGA3	Q16281	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	PIM3	Q86V86	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	MMP21	Q8N119	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.9	□□□□□ -1.62
UBA3-204	ENST00000461522		H3BNX3	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-204	ENST00000461522	PRY	O14603	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-204	ENST00000461522	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-204	ENST00000461522	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-204	ENST00000461522	COQ9	O75208	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-204	ENST00000461522	USP12	O75317	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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