RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 ADGRF1Q5T601 910 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 C12orf40Q86WS4 652 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 AZIN2Q96A70 460 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF653Q96CK0 615 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 P2RY11Q96G91 374 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 BBS2Q9BXC9 721 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 PIGVQ9NUD9 493 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 NENFQ9UMX5 172 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 FAM170BA6NMN3 283 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 GFRA2O00451 464 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 ACSL4O60488 711 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 CDC25BP30305 580 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 CCR1P32246 355 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 PPP2R5DQ14738 602 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 ANO4Q32M45 955 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 BNIPLQ7Z465 357 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM105Q8N8V8 129 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 CD101Q93033 1021 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 TRIM11Q96F44 468 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 MCEEQ96PE7 176 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 NELL2Q99435 816 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-202ENST00000406506 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 PI15O43692 258 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 CACNG3O60359 315 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 ADCY5O95622 1261 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 MYBL1P10243 752 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 SLC2A3P11169 496 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 TYRP14679 529 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 PDGFRAP16234 1089 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 SDC4P31431 198 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 PTPN9P43378 593 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 DEUP1Q05D60 604 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 GSE1Q14687 1217 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 BHMTQ93088 406 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 RNF34Q969K3 372 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 CHP1Q99653 195 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 DEF6Q9H4E7 631 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.02■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 F9P00740 461 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 GPD1P21695 349 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 SLC6A4P31645 630 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 CXCR3P49682 368 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 GALK1P51570 392 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 ATP11AP98196 1134 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 MAMLD1Q13495 774 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 CCINQ13939 588 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 SLC18A3Q16572 532 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC14Q49A88 953 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 FYB2Q5VWT5 728 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 EXOC4Q96A65 974 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 PARVAQ9NVD7 372 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 PLK2Q9NYY3 685 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 ANKRD62A6NC57 917 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 TSPAN3O60637 253 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 TULP3O75386 442 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 ENDOD1O94919 500 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 CYBBP04839 570 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 DCNP07585 359 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 ABCB4P21439 1286 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 SLC6A11P48066 632 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 KDSRQ06136 332 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-202ENST00000406506 MESP2Q0VG99 397 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms