RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.29□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 DSEQ9UL01 958 aa6.29□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 USP18Q9UMW8 372 aa6.29□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 USTQ9Y2C2 406 aa6.29□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TSC2P49815 1807 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 H3BQF6 201 aa6.28□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 DAPK3O43293 454 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 LIASO43766 372 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 B4GALT3O60512 393 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 HSF2BPO75031 334 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PPFIA2O75334 1257 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 DAB1O75553 588 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 RNF8O76064 485 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 BEST1O76090 585 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 B3GAT3O94766 335 aa6.28□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 FBXO21O94952 628 aa6.28□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 ADORA2BP29275 332 aa6.28□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 ABL2P42684 1182 aa6.28□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 HDAC4P56524 1084 aa6.28□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 LMNB2Q03252 620 aa6.28□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PDK2Q15119 407 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TAF5Q15542 800 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC142Q17RM4 750 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 BEND5Q7L4P6 421 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 STRADAQ7RTN6 431 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.28□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 HTTP42858 3142 aa6.28□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 LRRD1A4D1F6 860 aa6.27□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.27□□□□□ -1.41
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C6orf48-208ENST00000395788 CACNA2D1P54289 1103 aa6.27□□□□□ -1.41
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C6orf48-208ENST00000395788 FAAP100Q0VG06 881 aa6.27□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 DPYSL3Q14195 570 aa6.27□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 DPYSL2Q16555 572 aa6.27□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 TCTN1Q2MV58 587 aa6.27□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
C6orf48-208ENST00000395788 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.27□□□□□ -1.41
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