RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 A0A087WXM4 84 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 SHBGP04278 402 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 KCNMA1Q12791 1236 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 AP3B2Q13367 1082 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 MAPRE2Q15555 327 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 FANK1Q8TC84 345 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 HERVK_113Q902F9 699 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 PEX13Q92968 403 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 SCYL1Q96KG9 808 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 EHD3Q9NZN3 535 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 SLIT3O75094 1523 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 DNAJB5O75953 348 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 GNASQ5JWF2 1037 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 P2RX5Q93086 422 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 THAP9Q9H5L6 903 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 POTECB2RU33 542 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 ABL1P00519 1130 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 RCAN1P53805 252 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 RAD23AP54725 363 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 NPEPPSP55786 919 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 FOLH1Q04609 750 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 BFSP2Q13515 415 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 CENPUQ71F23 418 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 KRT78Q8N1N4 520 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 RIN3Q8TB24 985 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 AKAP10O43572 662 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 TOM1L1O75674 476 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 UQCRBP14927 111 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 ALOX12P18054 663 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 PCP4P48539 62 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 CYP4F2P78329 520 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 CYP4F3Q08477 520 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 NAB1Q13506 487 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 COPG2Q9UBF2 871 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 SNX24Q9Y343 169 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.06□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PRQ8 180 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 PRCPP42785 496 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 ATP5OP48047 213 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 CD83Q01151 205 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 CAMK2BQ13554 666 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 PTPAQ15257 358 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 SLC35B4Q969S0 331 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 PIK3C2AO00443 1686 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 PDHXO00330 501 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 GPC4O75487 556 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 ITGB3P05106 788 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 SLURP2P0DP57 97 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 CYP2C8P10632 490 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 AP3M2P53677 418 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 NEPROQ6NW34 567 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 POLIQ9UNA4 740 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.05□□□□□ -0.16
CTIF-202ENST00000382998 V9GYQ6 96 aa14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms