RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 CDCP1Q9H5V8 836 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PPCSQ9HAB8 311 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 NFU1Q9UMS0 254 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 DAPP1Q9UN19 280 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM232C9JQI7 657 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP6R2O75170 966 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PPFIA2O75334 1257 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 THBS4P35443 961 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 AGTR2P50052 363 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CBFBQ13951 182 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CNGA3Q16281 694 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF398Q8TD17 642 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MORC4Q8TE76 937 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FAR2Q96K12 515 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 C5orf34Q96MH7 638 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMD1Q99460 953 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MECRQ9BV79 373 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS16Q9H269 839 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC34A8MYJ7 566 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PRYO14603 147 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 NKX2-8O15522 239 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PIP5K1CO60331 668 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 LARGE1O95461 756 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 HALP42357 657 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.41□□□□□ -1.77e-18■■□□□ 13.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC23BQ15437 767 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF569Q5MCW4 686 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ANO1Q5XXA6 986 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 LAS2Q8IYD9 372 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 HMGB4Q8WW32 186 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CCT6BQ92526 530 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PAGR1Q9BTK6 254 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 NUAK2Q9H093 628 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 EFCAB8A8MWE9 144 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 KAT7O95251 611 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBB4AP04350 444 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 PEPDP12955 493 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFS1P28331 727 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CD38P28907 300 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXD12P35452 270 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 STAT6P42226 847 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS41P49754 854 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK7P50613 346 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF84P51523 738 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXL2P58012 376 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 POSTNQ15063 836 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 TIGD6Q17RP2 521 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP78Q5JTW2 689 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC22Q5TAA0 569 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR93Q6P2C0 686 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SYCE2Q6PIF2 218 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA5Q8NB90 893 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB21Q9UL25 225 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 MAFFQ9ULX9 164 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-202ENST00000370826 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
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