RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357207.8

TRAPPC11-202, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC11, Length 4,435 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-202ENST00000357207 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 HYIQ5T013 277 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 BBS12Q6ZW61 710 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 DLG3Q92796 817 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 FICDQ9BVA6 458 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 CLIC5Q9NZA1 410 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SATB2Q9UPW6 733 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SIGLEC16A6NMB1 481 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 INPP4BO15327 924 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 PIGNO95427 931 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 HMGCRP04035 888 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 TPBGLP0DKB5 382 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 UBE3AQ05086 875 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 VEPH1Q14D04 833 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 TMC7Q7Z402 723 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 MKL1Q969V6 931 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SH3KBP1Q96B97 665 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 MICAL2O94851 1124 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 FAM136AQ96C01 138 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SEPHS2Q99611 448 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 BBS2Q9BXC9 721 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SYTL2Q9HCH5 934 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 CCDC167Q9P0B6 97 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 COPG2Q9UBF2 871 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 A0A1W2PPM1 405 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 VWA5AO00534 786 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 VPS26AO75436 327 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 PGM3O95394 542 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 CACHD1Q5VU97 1274 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SCUBE3Q8IX30 993 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 FITM2Q8N6M3 262 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SLC2A3P11169 496 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 AKT1P31749 480 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 ALDH1A3P47895 512 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 NSMCE2Q96MF7 247 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 BDH2Q9BUT1 245 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 A0A087WZ62 844 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 LDLRP01130 860 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 NPY2RP49146 381 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SLC26A2P50443 739 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 NAB1Q13506 487 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 GRIK5Q16478 980 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 TRIM69Q86WT6 500 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 ASB7Q9H672 318 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 DDX5P17844 614 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SLC25A23Q9BV35 468 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 TMEM109Q9BVC6 243 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 IDI2Q9BXS1 227 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 BCL9O00512 1426 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 BANF1O75531 89 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 NAGLUP54802 743 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 PDK3Q15120 406 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 ARCQ7LC44 396 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 WDR41Q9HAD4 459 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 WDR70Q9NW82 654 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 WWOXQ9NZC7 414 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 ROBO3Q96MS0 1386 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 TADA2AO75478 443 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 FBXO21O94952 628 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 NOMO3P69849 1222 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC11-202ENST00000357207 SNX31Q8N9S9 440 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms