RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000350881.6

THBS4-201, Transcript of thrombospondin 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4-201ENST00000350881 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.91□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.91□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.91□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 SAR1AQ9NR31 198 aa14.91□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 HPCAP84074 193 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 DPP9Q86TI2 863 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 CDCA5Q96FF9 252 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 DPP3Q9NY33 737 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 ZMPSTE24O75844 475 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 BBOF1Q8ND07 529 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 HASPINQ8TF76 798 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 ACKR2O00590 384 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 KRT34O76011 436 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 RARBP10826 455 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 KCNA4P22459 653 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 LMNB2Q03252 620 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 GSTA3Q16772 222 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 FAM219BQ5XKK7 198 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 STKLD1Q8NE28 680 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.9□□□□□ -0.02
THBS4-201ENST00000350881 I3L4J1 428 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 KRT7P08729 469 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 EFNA5P52803 228 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 HAPLN3Q96S86 360 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 ZNF358Q9NW07 568 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 COPEO14579 308 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 SDC4P31431 198 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 CAV1Q03135 178 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 MORF4L2Q15014 288 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 USP33Q8TEY7 942 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 RNF39Q9H2S5 420 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 TLE6Q9H808 572 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 NFASCO94856 1347 aa14.89□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 CAPN8A6NHC0 703 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 GPD1P21695 349 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 ADORA2AP29274 412 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 PHBP35232 272 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 NDUFV1P49821 464 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 PSMD7P51665 324 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 CDK16Q00536 496 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 PDK3Q15120 406 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 ARMCX2Q7L311 632 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 PGBD4Q96DM1 585 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 CNBD2Q96M20 576 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 TRIP11Q15643 1979 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 ALOX15BO15296 676 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 METTL18O95568 372 aa14.88□□□□□ -0.03
THBS4-201ENST00000350881 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms