RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 EMCNQ9ULC0 261 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 A6NJR5 290 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 A8MXQ7 604 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 KLF11O14901 512 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 MFSD11O43934 449 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 KRT38O76015 456 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 TEKT4Q8WW24 435 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 ACSS2Q9NR19 701 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 KRT82Q9NSB4 513 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 PNPOQ9NVS9 261 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 KLK14Q9P0G3 267 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 MDM4O15151 490 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 SPTLC1O15269 473 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 USP12O75317 370 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 GCATO75600 419 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A27O95847 323 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 IL1BP01584 269 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 PRKCGP05129 697 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 ERVK-10P10266 1014 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRR-202ENST00000342084 CD1EP15812 388 aa7.49□□□□□ -1.21
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