RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 DERAQ9Y315 318 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A0A0MRY4 1105 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 CXCL11O14625 94 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 CYP2C8P10632 490 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 IRX4P78413 519 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 MXRA7P84157 204 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 CCNJLQ8IV13 435 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXO27Q8NI29 283 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATA13Q96N96 652 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 THTPAQ9BU02 230 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 GLRA3O75311 464 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 SCNN1AP37088 669 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGAP8P85298 464 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 RFX8Q6ZV50 586 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ULK2Q8IYT8 1036 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 GPC2Q8N158 579 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 MGAMO43451 1857 aa22.16■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ARL4AP40617 200 aa22.15■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.15■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.15■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.15■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 EBF4Q9BQW3 602 aa22.15■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.15■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 COL1A2P08123 1366 aa22.15■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.14■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 DGKIO75912 1065 aa22.14■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ERO1BQ86YB8 467 aa22.14■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.14■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.14■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 NME7Q9Y5B8 376 aa22.14■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 LCP1P13796 627 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 AOC1P19801 751 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ACTR3P61158 418 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 MBLAC2Q68D91 279 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PACS1Q6VY07 963 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC185Q8N715 623 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SYT15Q9BQS2 421 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 APOL6Q9BWW8 343 aa22.14■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.14■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 GOT1P17174 413 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC1A6P48664 564 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 BCAT1P54687 386 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 GRIK3Q13003 919 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 NAB1Q13506 487 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 C16orf46Q6P387 395 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ARMCX2Q7L311 632 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 BEST2Q8NFU1 509 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 OLFM3Q96PB7 478 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 NAT9Q9BTE0 207 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 TPP1O14773 563 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 KLHL2O95198 593 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 VAV1P15498 845 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PGAM1P18669 254 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ACADSBP45954 432 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 AP2B1P63010 937 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 STRADAQ7RTN6 431 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 YIPF3Q9GZM5 350 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC7A8Q9UHI5 535 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SCOCQ9UIL1 159 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SOX13Q9UN79 622 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.13■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 NPTXRO95502 500 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 ADORA2BP29275 332 aa22.12■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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