RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.5■□□□□ 0.55
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ACTB-201ENST00000331789 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 C8orf48Q96LL4 319 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 OR12D3Q9UGF7 316 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 LGALS13Q9UHV8 139 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 HOXA2O43364 376 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 CREB1P16220 341 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 ELK3P41970 407 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
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