RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076313.12

Prpf40a-201, Transcript of Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf40a, Length 7,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Mib1Q80SY4 1006 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 WdpcpQ8C456 722 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Parp9Q8CAS9 866 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Senp2Q91ZX6 588 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Dqx1Q924H9 718 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Ddit4Q9D3F7 229 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Usp32F8VPZ3 1604 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 FanceB8JJD6 213 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 AlpiF8VPQ6 554 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 XntrpcF8VQM8 1264 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Akr1clQ3UXL1 322 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 P3h1Q3V1T4 739 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Fam192aQ91WE2 254 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Prmt7Q922X9 692 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Q99LU8 229 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Mzt2Q9CQ25 159 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Pbld2Q9CXN7 288 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Acsl4Q9QUJ7 711 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Trpc2Q9R244 1172 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Cd97Q9Z0M6 818 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 DgkhD3YXJ0 1156 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Pou2f3P31362 431 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Rnf145Q5SWK7 663 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Nr6a1Q64249 495 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 GmppbQ8BTZ7 360 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Gucy1b2Q8BXH3 824 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Brat1Q8C3R1 822 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Znf445Q8R2V3 986 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Olfr474Q8VFC9 310 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Q9D4A5 307 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 TcimQ9D915 106 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa9.6□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Smok3aC0HKC8 504 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Smok3bC0HKC9 504 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Tbc1d10aP58802 500 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Yy1Q00899 414 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Tll1Q62381 1013 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 DcstampQ7TNJ0 470 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Slitrk1Q810C1 696 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Setdb2Q8C267 713 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Bhmt2Q91WS4 363 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Lsm7Q9CQQ8 103 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Znf687Q9D2D7 1237 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Tmem79Q9D709 391 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Dkk3Q9QUN9 349 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Unc5cO08747 931 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Slc1a2P43006 572 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 B3gat3P58158 335 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Snai1Q02085 264 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Pde1aQ61481 565 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Efr3aQ8BG67 819 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 CoprsQ9CQ13 173 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Grk4O70291 574 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Vps26aP40336 327 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Mief2Q5NCS9 454 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Hist2h2acQ64523 129 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Hist2h2aa1Q6GSS7 130 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Hmgb4Q6P8W9 181 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Prrg3Q6PAQ9 231 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Fam20bQ8VCS3 409 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 DarsQ922B2 501 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 HemgnQ9ERZ0 503 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Nrxn1Q9CS84 1514 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Psma3O70435 255 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Vsx2Q61412 361 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 PolnQ7TQ07 864 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 EtnpplQ8BWU8 499 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Usp20Q8C6M1 916 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Rab36Q8CAM5 267 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 DnerQ8JZM4 737 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Tada1Q99LM9 335 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Rab11fip1Q9D620 645 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Capn6O35646 641 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Hspa1bP17879 642 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Ppm1jQ149T7 507 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Pyroxd1Q3TMV7 498 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Fam173bQ9D1Z3 247 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Q9D2Q3 444 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Ndel1Q9ERR1 345 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Kifc1Q9QWT9 674 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Copg2Q9QXK3 871 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 BrafP28028 804 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 RadilQ69Z89 1099 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 AgpsQ8C0I1 645 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Adam32Q8K410 754 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Haus3Q8QZX2 570 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Gmcl1Q920G9 524 aa9.59□□□□□ -0.87
Prpf40a-201ENSMUST00000076313 Vmp1Q99KU0 406 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.1 ms