RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mcph1Q7TT79 822 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mettl21cQ8BLU2 248 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aph1bQ8C7N7 257 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slco4a1Q8K078 723 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr395Q8VGR3 312 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snrnp25Q8VIK1 123 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnh1Q91VI7 456 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp6v1b1Q91YH6 513 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ophn1Q99J31 802 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Homer3Q99JP6 356 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NonoQ99K48 473 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmd9Q9CR00 222 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt20Q9D312 431 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stap1Q9JM90 297 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hey2Q9QUS4 339 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dach1Q9QYB2 751 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TfgQ9Z1A1 397 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DcxO88809 366 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tac1P41539 130 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MipP51180 263 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsd11b2P51661 386 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccr1P51675 355 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fdft1P53798 416 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dact3Q0PHV7 610 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Samd11Q1RNF8 542 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc38a5Q3U1J0 479 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atxn7l3bQ3UD01 97 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Agap2Q3UHD9 1186 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 McuQ3UMR5 350 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim38Q5SZ99 471 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aldh1a2Q62148 518 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il17aQ62386 158 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapk4Q6P5G0 583 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sort1Q6PHU5 825 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DstykQ6XUX1 927 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nemp1Q6ZQE4 437 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clec4b1Q7TS58 209 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NaprtQ8CC86 538 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl2Q8JZP3 593 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il36gQ8R460 164 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MyocdQ8VIM5 935 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itm2cQ91VK4 269 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TMEM121BQ99MX7 572 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clic3Q9D7P7 237 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plin3Q9DBG5 437 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab27aQ9ERI2 221 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nrip2Q9JHR9 270 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rabgap1lA6H6A9 815 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm28043E0CXC2 719 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Galntl6E5D8G1 601 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bub1O08901 1058 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syngr1O55100 234 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gjb1P28230 283 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gjb3P28231 270 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfm3P63056 478 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ezh1P70351 747 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gprin1Q3UNH4 932 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ADGRF3Q58Y75 991 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PigaQ64323 485 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RgnQ64374 299 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brsk2Q69Z98 735 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl17Q6TDP3 640 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr533Q7TRT7 320 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sema3dQ8BH34 777 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl38Q8BSF5 581 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clic5Q8BXK9 251 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C8aQ8K182 587 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pacs1Q8K212 961 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Colgalt1Q8K297 617 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eva1bQ8K2Y3 164 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl58Q8R035 206 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sorcs3Q8VI51 1219 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgef3Q91X46 524 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glra3Q91XP5 464 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndfip2Q91ZP6 311 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdia5Q921X9 517 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trem2Q99NH8 227 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rec114Q9CWH4 259 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Utp11Q9CZJ1 253 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam3aQ9D8T0 230 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dhtkd1A2ATU0 921 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh2d4bA6X942 431 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r84D3YWE3 849 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc1a6O35544 561 aa6.79□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prom1O54990 867 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.3 ms