RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 KIF12Q96FN5 646 aa6.53□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.53□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CLN6Q9NWW5 311 aa6.53□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SFI1A8K8P3 1242 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 G3V2T6 193 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GNB5O14775 395 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CLOCKO15516 846 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 NCOA4Q13772 614 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 NR1I3Q14994 352 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ITIH5Q86UX2 942 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GPRASP2Q96D09 838 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RGS14O43566 566 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 USP17L8P0C7I0 530 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 VAV1P15498 845 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 STARP49675 285 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 HPS4Q9NQG7 708 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 URADA6NGE7 173 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ECE2O60344 883 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CYP2A13Q16696 494 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 XKRXQ6PP77 449 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 REEP1Q9H902 201 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MKLN1Q9UL63 735 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ABHD2P08910 425 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GYG1P46976 350 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CDH17Q12864 832 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 L1RE1Q9UN81 338 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 FGFR4P22455 802 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MYL9P24844 172 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 UGT1A5P35504 534 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CCNG1P51959 295 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 EFR3AQ14156 821 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 APOPT1Q96IL0 206 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM2Q9C040 744 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CKLFQ9UBR5 152 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 AK9Q5TCS8 1911 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1W2PQ72 361 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GCATO75600 419 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ERVK-10P10266 1014 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF12P17014 697 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PGAM1P18669 254 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 NFKB1P19838 968 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 NOS3P29474 1203 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 TAF6P49848 677 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 BCAT1P54687 386 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 GALCP54803 685 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SLC29A2Q14542 456 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZBTB6Q15916 424 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF394Q53GI3 561 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ADCK2Q7Z695 626 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 CMTM6Q9NX76 183 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms