RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612761.1

CFDP1-211, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CFDP1, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-211ENST00000612761 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 EGR1P18146 543 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 MMP8P22894 467 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 TNFSF4P23510 183 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 GABRB3P28472 473 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 DUSP1P28562 367 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 ID2Q02363 134 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 BFSP2Q13515 415 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 PMS2P11Q13670 270 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 ATP1A4Q13733 1029 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 CNGA3Q16281 694 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 TMEM196Q5HYL7 178 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 FAM209BQ5JX69 171 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 C10orf25Q5T742 122 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 PCGF6Q9BYE7 350 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 MTMR4Q9NYA4 1195 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 VPS4AQ9UN37 437 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 CLASP1Q7Z460 1538 aa4.92□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 OR2W5A6NFC9 320 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 TTC34A8MYJ7 566 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 RASA4BC9J798 803 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 SOCS2O14508 198 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 ADAM10O14672 748 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 INPPL1O15357 1258 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 RASA4O43374 803 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 FGF18O76093 207 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 NDST3O95803 873 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 MATN1P21941 496 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 NR4A2P43354 598 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 GSTM5P46439 218 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 CFHR1Q03591 330 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 SEMA3BQ13214 749 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 LAMB3Q13751 1172 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 DEF8Q6ZN54 512 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 GDF15Q99988 308 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 RGL1Q9NZL6 768 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 CEP83Q9Y592 693 aa4.91□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 TSPOAP1O95153 1857 aa4.9□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.9□□□□□ -1.62
CFDP1-211ENST00000612761 NCK2O43639 380 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 USP12O75317 370 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 CD63P08962 238 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 THBS4P35443 961 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 TM4SF4P48230 202 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 STIM1Q13586 685 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 MAPKAPK3Q16644 382 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 LONRF1Q17RB8 773 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 SKAP1Q86WV1 359 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 ZNF366Q8N895 744 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 ZNF566Q969W8 418 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.9□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 FAM234BA2RU67 622 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 RRHO14718 337 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 PRC1O43663 620 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 TLR2O60603 784 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 PLAUP00749 431 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 MYL1P05976 194 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 SRGAP2BP0DMP2 458 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 CTSAP10619 480 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 VPS41P49754 854 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 CCT4P50991 539 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 AK2P54819 239 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 PICALMQ13492 652 aa4.89□□□□□ -1.63
CFDP1-211ENST00000612761 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4.89□□□□□ -1.63
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