RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	CACNA1G	O43497	2377 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC28	Q96AY4	2481 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAJC6	O75061	913 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	FKTN	O75072	461 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP2R2A	P63151	447 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CLUL1	Q15846	466 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	HHAT	Q5VTY9	493 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DEFB106A	Q8N104	65 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ITFG2	Q969R8	447 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SH3GL3	Q99963	347 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CERS4	Q9HA82	394 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CNTN3	Q9P232	1028 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM186A	A6NE01	2351 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PMPCB	O75439	489 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP6V1G2	O95670	118 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DES	P17661	470 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	EPHB2	P29323	1055 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF844	Q08AG5	666 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DEFB118	Q96PH6	123 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232		H0Y3Z8	333 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PHF2	O75151	1096 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TJP3	O95049	919 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GOT1	P17174	413 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PNPLA4	P41247	253 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PEX5	P50542	639 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TKTL1	P51854	596 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PIGZ	Q86VD9	579 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	C3orf20	Q8ND61	904 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF208	Q9H0X6	261 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MPP6	Q9NZW5	540 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GGA2	Q9UJY4	613 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHL33	A6NCF5	533 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KBTBD13	C9JR72	458 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DIAPH2	O60879	1101 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ANP32D	O95626	131 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	HSPA6	P17066	643 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP2F1	P24903	491 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MAX	P61244	160 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCG8	Q9H221	673 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	AVPR1A	P37288	418 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GPR15	P49685	360 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	LILRA4	P59901	499 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP2R5E	Q16537	467 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PGBD4	Q96DM1	585 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	BATF3	Q9NR55	127 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MIOS	Q9NXC5	875 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1W2PPM1	405 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM120B	A0PK00	339 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TRAPPC3	O43617	180 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TADA2A	O75478	443 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GLRB	P48167	497 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MXRA7	P84157	204 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PDE1B	Q01064	536 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TAP1	Q03518	808 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PTP4A2	Q12974	167 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP4X1	Q8N118	509 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.16	□□□□□ -0.78

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