RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	B4GALT5	O43286	388 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	USP12	O75317	370 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	STBD1	O95210	358 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VNN2	O95498	520 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HOXB2	P14652	356 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SFN	P31947	248 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	JAK3	P52333	1124 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PTEN	P60484	403 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VEPH1	Q14D04	833 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TAF12	Q16514	161 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	APPL2	Q8NEU8	664 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BEST2	Q8NFU1	509 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MIB2	Q96AX9	1013 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM227B	Q96M60	508 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PNKP	Q96T60	521 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CD93	Q9NPY3	652 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VAV3	Q9UKW4	847 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MED13L	Q71F56	2210 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A0D9SFI3	127 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A1B0GUA9	196 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DFNA5	O60443	496 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SOAT2	O75908	522 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	USP17L7	P0C7H9	530 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TNFSF9	P41273	254 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GRIA2	P42262	883 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TNFRSF4	P43489	277 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ASIC1	P78348	528 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MESP2	Q0VG99	397 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ST3GAL1	Q11201	340 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TBR1	Q16650	682 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TXNDC8	Q6A555	127 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CENPP	Q6IPU0	288 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FERMT3	Q86UX7	667 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EID2	Q8N6I1	236 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TCP11	Q8WWU5	503 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A1W2PQF6	199 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ERICH2	A1L162	156 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CEACAM5	P06731	702 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ITGAV	P06756	1048 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CELA3A	P09093	270 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR4Q2	P0C623	313 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF224	P0DH78	156 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CALM1	P0DP23	149 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CALM2	P0DP24	149 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CALM3	P0DP25	149 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CD8B	P10966	210 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CKMT2	P17540	419 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ABCB4	P21439	1286 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	WAS	P42768	502 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC6A11	P48066	632 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CDR1	P51861	262 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	E2F1	Q01094	437 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TFDP1	Q14186	410 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF77	Q15935	545 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GAB4	Q2WGN9	574 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRR16	Q569H4	304 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANO5	Q75V66	913 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MON1A	Q86VX9	555 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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