RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-229ENST00000551936 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-229ENST00000551936 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-229ENST00000551936 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-229ENST00000551936 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-229ENST00000551936 RAD54BQ9Y620 910 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-229ENST00000551936 BICDL2A1A5D9 508 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 BIN1O00499 593 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CALCAP01258 141 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 LCP1P13796 627 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 NDUFV2P19404 249 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 STX17P56962 302 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 DAOAP59103 153 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 IRX4P78413 519 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 KCNH2Q12809 1159 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 PMF1Q6P1K2 205 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ARHGEF19Q8IW93 802 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 TRIM59Q8IWR1 403 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 EDEM1Q92611 657 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CNGB3Q9NQW8 809 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ZNF217O75362 1048 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 KCNK5O95279 499 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CYBBP04839 570 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 RGS7P49802 495 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 GCNT1Q02742 428 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CETN1Q12798 172 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ENPP2Q13822 863 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 STILQ15468 1287 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 SLC36A4Q6YBV0 504 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 RRAGAQ7L523 313 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 SYT12Q8IV01 421 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 DEFB119Q8N690 84 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 RNF139Q8WU17 664 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 SLC6A17Q9H1V8 727 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 STOML2Q9UJZ1 356 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 PILRBQ9UKJ0 227 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 STON1Q9Y6Q2 735 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 AP5Z1O43299 807 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 GNA14O95837 355 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 KCNA4P22459 653 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ITPKAP23677 461 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 BRD2P25440 801 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 IL12RB1P42701 662 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ZNF132P52740 706 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 PAK1Q13153 545 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 MPPE1Q53F39 396 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 TRIM61Q5EBN2 209 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 LYSMD4Q5XG99 296 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 TMEM215Q68D42 235 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 DDI1Q8WTU0 396 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 IRGQQ8WZA9 623 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 HSFY1Q96LI6 401 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CD93Q9NPY3 652 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 TMEM9BQ9NQ34 198 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 M0QYV0 167 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 PIK3R2O00459 728 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 NPC1O15118 1278 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 TSPAN3O60637 253 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 AFPP02771 609 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 DPP6P42658 865 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ZNF33AQ06730 810 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 MSANTD2Q6P1R3 559 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 UCMAQ8WVF2 138 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 NCOR2Q9Y618 2525 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CS-229ENST00000551936 MSI1O43347 362 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 468.8 ms