RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549123.5

TCTN1-222, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2

Gene TCTN1, Length 458 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-222	ENST00000549123	TEX33	O43247	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	B3GALT2	O43825	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CYBA	P13498	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CCL5	P13501	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	XBP1	P17861	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	EDNRB	P24530	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CALML3	P27482	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	GNA11	P29992	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CYP2C19	P33261	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CHN2	P52757	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	WASF1	Q92558	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	SEPT4	O43236	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	LPXN	O60711	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	STAM2	O75886	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	NDUFA10	O95299	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	SGPL1	O95470	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	GJB1	P08034	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	RAP2A	P10114	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	AKR1A1	P14550	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CCND2	P30279	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	SOX10	P56693	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	MXRA7	P84157	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	PGM5	Q15124	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	STXBP2	Q15833	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	UBE2S	Q16763	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	SNX21	Q969T3	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	NEU1	Q99519	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	OVOL3	O00110	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	JAK2	O60674	1132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	POMC	P01189	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	CYP3A4	P08684	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	TGFB3	P10600	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC6A9	P48067	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCTN1-222	ENST00000549123	NLRP5	P59047	1200 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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