RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 MFSD11O43934 449 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 KPNA6O60684 536 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 FAM155BO75949 473 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 GJA9P57773 515 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SLC18A2Q05940 514 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 BNIP1Q12981 228 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CCDC63Q8NA47 563 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 GAD1Q99259 594 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 KRT82Q9NSB4 513 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM51Q9NW97 253 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 M0QZ92 97 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 NRP1O14786 923 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CHRNA1P02708 482 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 FYNP06241 537 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 INHBAP08476 426 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CLCNKBP51801 687 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 NEK3P51956 506 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MAP3K7CLP57077 242 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 GNASQ5JWF2 1037 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 RNF169Q8NCN4 708 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 RNF139Q8WU17 664 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 KLC4Q9NSK0 619 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 M0QYT0 321 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 APOEP02649 317 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MT-ND3P03897 115 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 THP07101 528 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 GSTA2P09210 222 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 FAM200BP0CF97 657 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CYBAP13498 195 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ETV4P43268 484 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 TKTL1P51854 596 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 NCALDP61601 193 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC6Q86X45 466 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 LPPQ93052 612 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 LGMNQ99538 433 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SMOQ99835 787 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SYT15Q9BQS2 421 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 CHST12Q9NRB3 414 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 PIGVQ9NUD9 493 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 A0A0A0MRY4 1105 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ALADP13716 330 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 GRIA1P42261 906 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 LHX1P48742 406 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MGAT3Q09327 533 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 RAB41Q5JT25 222 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 FAM35AQ86V20 835 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MPP5Q8N3R9 675 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 PCED1BQ96HM7 432 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 APOPT1Q96IL0 206 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 SPATA13Q96N96 652 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 MED10Q9BTT4 135 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 VPS11Q9H270 941 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.48□□□□□ -0.09
LIMK1-208ENST00000538333 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms