RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514581.1

MRPS18C-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S18C, human

TSL 2

Gene MRPS18C, Length 301 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS18C-209	ENST00000514581	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	FCRL5	Q96RD9	977 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	WDR26	Q9H7D7	661 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	PRY	O14603	147 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	PMM2	O15305	246 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	DHH	O43323	396 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	EGR1	P18146	543 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	DRD1	P21728	446 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	MATN1	P21941	496 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	RPS6KB1	P23443	525 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	HOXD12	P35452	270 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	CPA2	P48052	419 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ZNF84	P51523	738 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	SEMA3B	Q13214	749 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	CNGA3	Q16281	694 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ACSM6	Q6P461	480 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	PJA1	Q8NG27	643 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	WAC	Q9BTA9	647 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	TRMO	Q9BU70	441 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	RGL1	Q9NZL6	768 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	VPS4A	Q9UN37	437 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ANO9	A1A5B4	782 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	TTC34	A8MYJ7	566 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	USP12	O75317	370 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	FGF18	O76093	207 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	NDST3	O95803	873 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	IDE	P14735	1019 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ME1	P48163	572 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	LINC00205	P59089	165 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	B4GALNT1	Q00973	533 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	MTX1	Q13505	466 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	BFSP2	Q13515	415 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	SKAP1	Q86WV1	359 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	RFX6	Q8HWS3	928 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	LAS2	Q8IYD9	372 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	GLMP	Q8WWB7	406 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	PIGK	Q92643	395 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	GJA10	Q969M2	543 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	POT1	Q9NUX5	634 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	MYMK	A6NI61	221 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581		M0QZQ0	153 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	TRIM38	O00635	465 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	INSIG1	O15503	277 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	NCK2	O43639	380 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	FGF2	P09038	288 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	TM4SF4	P48230	202 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	SOX2	P48431	317 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	VPS41	P49754	854 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	SLC12A2	P55011	1212 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	FHL1	Q13642	323 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MRPS18C-209	ENST00000514581	PMS2P11	Q13670	270 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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