RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 MFAP3P55082 362 aa20.17■□□□□ 0.82
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SH3BP2-220ENST00000511663 CUL2Q13617 745 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.17■□□□□ 0.82
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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SH3BP2-220ENST00000511663 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.15■□□□□ 0.82
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SH3BP2-220ENST00000511663 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.14■□□□□ 0.81
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SH3BP2-220ENST00000511663 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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SH3BP2-220ENST00000511663 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.13■□□□□ 0.81
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SH3BP2-220ENST00000511663 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 PSMA7O14818 248 aa20.12■□□□□ 0.81
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SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R2P41236 205 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF234Q14588 700 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 EDEM1Q92611 657 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 NUP58Q9BVL2 599 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR174Q9BXC1 333 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-220ENST00000511663 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.12■□□□□ 0.81
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