RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 SPG21Q9NZD8 308 aa9.13□□□□□ -0.95
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SNHG16-202ENST00000493536 PGFP49763 221 aa9.11□□□□□ -0.95
SNHG16-202ENST00000493536 PSEN1P49768 467 aa9.11□□□□□ -0.95
SNHG16-202ENST00000493536 PMS2P54278 862 aa9.11□□□□□ -0.95
SNHG16-202ENST00000493536 GBE1Q04446 702 aa9.11□□□□□ -0.95
SNHG16-202ENST00000493536 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.11□□□□□ -0.95
SNHG16-202ENST00000493536 RFX8Q6ZV50 586 aa9.11□□□□□ -0.95
SNHG16-202ENST00000493536 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SNHG16-202ENST00000493536 VPS52Q8N1B4 723 aa9.11□□□□□ -0.95
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