RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	SPATA1	Q5VX52	437 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	WDR49	Q8IV35	697 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	RAPGEF5	Q92565	580 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	REEP2	Q9BRK0	252 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNK12	Q9HB15	430 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CHST7	Q9NS84	486 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF711	Q9Y462	761 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	YIPF1	Q9Y548	306 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TTC3	P53804	2025 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM150B	A6NC51	233 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	AOC1	P19801	751 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CYP2J2	P51589	502 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CLCN4	P51793	760 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TNFRSF25	Q93038	417 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ATP2A3	Q93084	1043 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	GJA10	Q969M2	543 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	HPDL	Q96IR7	371 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	GBP5	Q96PP8	586 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SYT15	Q9BQS2	421 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ACBD6	Q9BR61	282 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	VCX3B	Q9H321	246 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CA14	Q9ULX7	337 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CACNA1B	Q00975	2339 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	LACTBL1	A8MY62	500 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	B4GALT5	O43286	388 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	FSBP	O95073	299 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CTDNEP1	O95476	244 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	F13A1	P00488	732 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CXCL8	P10145	99 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	GALNS	P34059	522 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	NCKAP1L	P55160	1127 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ST8SIA6	P61647	398 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	GTF2B	Q00403	316 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CYP27A1	Q02318	531 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	MPP3	Q13368	585 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CUL4A	Q13619	759 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	EOGT	Q5NDL2	527 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM3C	Q92520	227 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		5.03	□□□□□ -1.6
KRIT1-222	ENST00000486261	LRRC72	A6NJI9	287 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	CHAD	O15335	359 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	LINC01565	O15544	149 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	ERLIN1	O75477	346 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	DRD1	P21728	446 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	AFM	P43652	599 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	BRCC3	P46736	316 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	CNTD1	Q8N815	330 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	AGAP3	Q96P47	875 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	CDH19	Q9H159	772 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC32A1	Q9H598	525 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		5.02	□□□□□ -1.61
KRIT1-222	ENST00000486261	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61

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