RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
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SH3BP1-206ENST00000469947 C6orf52Q5T4I8 152 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP1-206ENST00000469947 MARVELD2Q8N4S9 558 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF148Q8N7C7 305 aa13.97□□□□□ -0.17
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SH3BP1-206ENST00000469947 RNPEPQ9H4A4 650 aa13.97□□□□□ -0.17
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SH3BP1-206ENST00000469947 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
SH3BP1-206ENST00000469947 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
SH3BP1-206ENST00000469947 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
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SH3BP1-206ENST00000469947 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP1-206ENST00000469947 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
SH3BP1-206ENST00000469947 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
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