RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CPT1B	Q92523	772 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NELL1	Q92832	810 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	MED15	Q96RN5	788 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006		E7EVH7	732 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SPTLC2	O15270	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	C1QL1	O75973	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	STARD3NL	O95772	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	DNTT	P04053	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ANXA6	P08133	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	KLRK1	P26718	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RARRES1	P49788	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ROR1	Q01973	937 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GPR68	Q15743	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NPY5R	Q15761	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006		A0A1W2PS29	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PPP6R2	O75170	966 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PTP4A3	O75365	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PIAS2	O75928	621 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SGPL1	O95470	568 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ACADM	P11310	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ABCD3	P28288	659 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SERPINA4	P29622	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	HOXD13	P35453	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SATB1	Q01826	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GALNT2	Q10471	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	GPS1	Q13098	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	TAF11	Q15544	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	BAK1	Q16611	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	VPS16	Q9H269	839 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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