RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 NOTUMQ6P988 496 aa21.16■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.16■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 GJD2Q9UKL4 321 aa21.16■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.16■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 SCN1AP35498 2009 aa21.16■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 CITO14578 2027 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 IL1BP01584 269 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 TPBGLP0DKB5 382 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 CCNFP41002 786 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 ATG16L1Q676U5 607 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 FAM131BQ86XD5 332 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 TRIM42Q8IWZ5 723 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
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IMP4-208ENST00000460766 FCHO1O14526 889 aa21.15■□□□□ 0.98
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IMP4-208ENST00000460766 NUDCD3Q8IVD9 361 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 LGMNQ99538 433 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 SNX25Q9H3E2 840 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 KLK14Q9P0G3 267 aa21.15■□□□□ 0.98
IMP4-208ENST00000460766 HMX2A2RU54 273 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 TOMM70O94826 608 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 KITP10721 976 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 ARL4AP40617 200 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 CCNG1P51959 295 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SEMA5AQ13591 1074 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 DPP9Q86TI2 863 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 NETO2Q8NC67 525 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 FBXO41Q8TF61 875 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 WDR27A2RRH5 827 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 KPNA7A9QM74 516 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 VAV1P15498 845 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 CRADDP78560 199 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SARNPP82979 210 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 MCUR1Q96AQ8 359 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 C7orf26Q96N11 449 aa21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.13■□□□□ 0.97
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IMP4-208ENST00000460766 GPR32O75388 356 aa21.13■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SLC8A3P57103 927 aa21.13■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 TAF11Q15544 211 aa21.13■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.13■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 CES4AQ5XG92 561 aa21.13■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.13■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 MKS1Q9NXB0 559 aa21.13■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 COX16Q9P0S2 106 aa21.13■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SIRPGQ9P1W8 387 aa21.13■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 PDHXO00330 501 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 GSC2O15499 205 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SERPINB9P50453 376 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 IRX4P78413 519 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 ALKAL1Q6UXT8 129 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 RINLQ6ZS11 566 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.12■□□□□ 0.97
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IMP4-208ENST00000460766 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 A0A0A0MRY4 1105 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 CRHR1P34998 444 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 ACADSBP45954 432 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SULT1E1P49888 294 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 KRT72Q14CN4 511 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 ARCQ7LC44 396 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SPATA13Q96N96 652 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 CEP41Q9BYV8 373 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SLC17A6Q9P2U8 582 aa21.12■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 DGKIO75912 1065 aa21.11■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 SCNN1AP37088 669 aa21.11■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 MATKP42679 507 aa21.11■□□□□ 0.97
IMP4-208ENST00000460766 AP1B1Q10567 949 aa21.11■□□□□ 0.97
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