RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ALFQ53S48 1182 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 EMC1Q8N766 993 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC5A5Q92911 643 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM169Q96HH4 297 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KLK14Q9P0G3 267 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA2Q9UM82 520 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP98P52948 1817 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM13O60858 407 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 AKAP3O75969 853 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT6AP02538 564 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT6BP04259 564 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NPTX2P47972 431 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT6CP48668 564 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ILDR2Q71H61 639 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SV2AQ7L0J3 742 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 OLFM1Q99784 485 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 IL25Q9H293 177 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM114B3SHH9 223 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3CDO00329 1044 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D12O60347 775 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1G2O95670 118 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CRTAMO95727 393 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 LDLRP01130 860 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GP5P40197 560 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NAMPTP43490 491 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 HERVK_113P62684 666 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC34A1Q06495 639 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ORC1Q13415 861 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SDE2Q6IQ49 451 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM48Q8IWZ4 208 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPHS2Q99611 448 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 COMMD8Q9NX08 183 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL3Q9UH77 587 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KBTBD13C9JR72 458 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 INPP4BO15327 924 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINE1P05121 402 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 INAQ16352 499 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF284Q2VY69 593 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC22A9Q8IVM8 553 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGED4Q96JG8 741 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CATSPER2Q96P56 530 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPXA8MT69 81 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NCAM2O15394 837 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DDHD2O94830 711 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GLP2RO95838 553 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CKMP06732 381 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP4CP60510 307 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MTMR8Q96EF0 704 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 UBXN6Q9BZV1 441 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CISHQ9NSE2 258 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL28Q9NXS3 571 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CROTQ9UKG9 612 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP2R1BP30154 601 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 HALP42357 657 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GIT2Q14161 759 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MYBPC2Q14324 1141 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF544Q6NX49 715 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms