RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.54■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 LNP1A1A4G5 178 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 P4HA2O15460 535 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 MAP3K13O43283 966 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 ADRB1P08588 477 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 SETSIPP0DME0 302 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 DAOAP59103 153 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 PAK1Q13153 545 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 RNF43Q68DV7 783 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 PIGKQ92643 395 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 PLD4Q96BZ4 506 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 SPACA7Q96KW9 195 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 EDEM2Q9BV94 578 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 SLC6A17Q9H1V8 727 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 CD93Q9NPY3 652 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM74BQ9NUR3 256 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 CKAP5Q14008 2032 aa23.53■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 MSI1O43347 362 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 NDUFV2P19404 249 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF132P52740 706 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 MARSP56192 900 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 CNGA2Q16280 664 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 LPCAT2Q7L5N7 544 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 CPXM2Q8N436 756 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 DEFB119Q8N690 84 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 CLEC4CQ8WTT0 213 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 CNGB3Q9NQW8 809 aa23.52■■□□□ 1.36
KDELR3-202ENST00000409006 M0QYV0 167 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 KCNA4P22459 653 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 IRX4P78413 519 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 SDE2Q6IQ49 451 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 SCML4Q8N228 414 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 MED15Q96RN5 788 aa23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 C4orf47A7E2U8 309 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 GNA14O95837 355 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 GCNT1Q02742 428 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 CETN1Q12798 172 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 CAMK4Q16566 473 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 DDI1Q8WTU0 396 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 RNF139Q8WU17 664 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 STON1Q9Y6Q2 735 aa23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 TSPAN3O60637 253 aa23.49■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 IL12RB1P42701 662 aa23.49■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM215Q68D42 235 aa23.49■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 MRGPRX1Q96LB2 322 aa23.49■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 CYP8B1Q9UNU6 501 aa23.49■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 GFRA2O00451 464 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 CYBBP04839 570 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 ITPKAP23677 461 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 HARS2P49590 506 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 SORCS1Q8WY21 1168 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.48■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 SGSHP51688 502 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 ENPP2Q13822 863 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 TRIM61Q5EBN2 209 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 MSANTD2Q6P1R3 559 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 SYT12Q8IV01 421 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 MIS12Q9H081 205 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 ELOVL2Q9NXB9 296 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 STOML2Q9UJZ1 356 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 PILRBQ9UKJ0 227 aa23.47■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 FYNP06241 537 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 UBE2HP62256 183 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 STILQ15468 1287 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 FUT11Q495W5 492 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 SPDYCQ5MJ68 293 aa23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
KDELR3-202ENST00000409006 LYSMD4Q5XG99 296 aa23.46■■□□□ 1.35
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