RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 PLXNA3P51805 1871 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 H3BQF6 201 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SEC24AO95486 1093 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 FGBP02675 491 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SOD2P04179 222 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ITIH2P19823 946 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 HSD17B3P37058 310 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 GGCXP38435 758 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 CBX1P83916 185 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 NOMO1Q15155 1222 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 P3H1Q32P28 736 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 RASIP1Q5U651 963 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SLC8B1Q6J4K2 584 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM169Q96HH4 297 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 RRN3Q9NYV6 651 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 IL37Q9NZH6 218 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 WHRNQ9P202 907 aa15.93■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 H7C0C1 242 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 EFCAB14O75071 495 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 TBX18O95935 607 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 F9P00740 461 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV3-25P01717 112 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ATF2P15336 505 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ATP5OP48047 213 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 TAF10Q12962 218 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 GPS1Q13098 491 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 CALCOCO2Q13137 446 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 EFHC2Q5JST6 749 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 TMC3Q7Z5M5 1100 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 MON1AQ86VX9 555 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 VSIG1Q86XK7 387 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 MREGQ8N565 214 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 RNF139Q8WU17 664 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 RNF34Q969K3 372 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ZIM3Q96PE6 472 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SLC9A7Q96T83 725 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.92■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 MCF2LO15068 1137 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 BAIAP3O94812 1187 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SYN1P17600 705 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ATF6P18850 670 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 TGM2P21980 687 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJB2P25686 324 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 YWHAQP27348 245 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 CHKAP35790 457 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ARL4AP40617 200 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 IQCKQ8N0W5 287 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC89Q8N998 374 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO32Q969P5 355 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 NTAN1Q96AB6 310 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 USP29Q9HBJ7 922 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 AAASQ9NRG9 546 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SPG21Q9NZD8 308 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 BACE2Q9Y5Z0 518 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF487B1APH4 448 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SYF2O95926 243 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 RBL1P28749 1068 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 RPL22P35268 128 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 DSG1Q02413 1049 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM240Q5SV17 173 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 BEND5Q7L4P6 421 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.91■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 PPFIA2O75334 1257 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 LAG3P18627 525 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 GBP1P32455 592 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 FPGSQ05932 587 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SCAPQ12770 1279 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SMARCB1Q12824 385 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 SEMA3BQ13214 749 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 ARL13BQ3SXY8 428 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC25Q86WR0 208 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 C7orf61Q8IZ16 206 aa15.9■□□□□ 0.14
CASQ1-201ENST00000368078 KRT222Q8N1A0 295 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms