RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SPACA6W5XKT8 324 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PLIN5Q00G26 463 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD10Q14728 455 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CIPCQ9C0C6 399 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 IQGAP1P46940 1657 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MPOP05164 745 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A3Q01959 620 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DSG1Q02413 1049 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CBWD6Q4V339 395 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 WDR41Q9HAD4 459 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 NFASCO94856 1347 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ITSN1Q15811 1721 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 GHRP10912 638 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 VCLP18206 1134 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 GPC1P35052 558 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 NPY2RP49146 381 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CYP51A1Q16850 503 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ERAP2Q6P179 960 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB106AQ8N104 65 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 GPC2Q8N158 579 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PORCNQ9H237 461 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ACTR8Q9H981 624 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 E9PBE3 544 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL41O60662 606 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJB2P25686 324 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PRKCIP41743 596 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ELOVL6Q9H5J4 265 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PDP2Q9P2J9 529 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PRR23AA6NEV1 266 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF23P17027 643 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CDC16Q13042 620 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PRKAA1Q13131 559 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 JADE3Q92613 823 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF711Q9Y462 761 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 APOC2P02655 101 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 AMPD1P23109 780 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MIPP30301 263 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 VAT1Q99536 393 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MMRN1Q13201 1228 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 USP20Q9Y2K6 914 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DDHD2O94830 711 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TUBP50607 506 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 RHBDL3P58872 404 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM60Q495X7 471 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DYRK1BQ9Y463 629 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MGAT4DA6NG13 374 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 HACD1B0YJ81 288 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 H3BQF6 201 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 UBDO15205 165 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINE1P05121 402 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN4P29074 926 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 GSNP06396 782 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1B1P15313 513 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 DDR1Q08345 913 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 GRTP1Q5TC63 336 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK1O00180 336 aa20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.9 ms