RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 EDEM2Q9BV94 578 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 ST7Q9NRC1 585 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 KLKB1P03952 638 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 CYBBP04839 570 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 DGKGP49619 791 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 DAOAP59103 153 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 CREB5Q02930 508 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 EMC10Q5UCC4 262 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 SCML4Q8N228 414 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 IRGQQ8WZA9 623 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 HSFY1Q96LI6 401 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 PLK2Q9NYY3 685 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 ANTXRLA6NF34 631 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 THAP12O43422 761 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 RHOBTB1O94844 696 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 FBXO21O94952 628 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 SLC9A1P19634 815 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 GNA15P30679 374 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 MAN2A1Q16706 1144 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 MIS12Q9H081 205 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 SGK1O00141 431 aa22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 TRIM24O15164 1050 aa22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 CAVIN2O95810 425 aa22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 SDE2Q6IQ49 451 aa22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 GJB7Q6PEY0 223 aa22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 INVSQ9Y283 1065 aa22.72■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 LTFP02788 710 aa22.71■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 GBP1P32455 592 aa22.71■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 ACADSBP45954 432 aa22.71■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 PMS2CLQ68D20 193 aa22.71■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 PGBD3Q8N328 593 aa22.71■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 DDI1Q8WTU0 396 aa22.71■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 ZZEF1O43149 2961 aa22.71■■□□□ 1.23
NME4-201ENST00000219479 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 LNP1A1A4G5 178 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 C4orf47A7E2U8 309 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 PON1P27169 355 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 MEA1Q16626 185 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 C11orf74Q86VG3 221 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 CHPFQ8IZ52 775 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 HMGB4Q8WW32 186 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 NDST4Q9H3R1 872 aa22.7■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 NTSR1P30989 418 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 GPD2P43304 727 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 APBA1Q02410 837 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 VWA3BQ502W6 1294 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 RASSF3Q86WH2 238 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 CPXM2Q8N436 756 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 IGF2RP11717 2491 aa22.69■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 FAM208BQ5VWN6 2430 aa22.68■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 KCNJ18B7U540 433 aa22.68■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 GIPC1O14908 333 aa22.68■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 ADAM23O75077 832 aa22.68■■□□□ 1.22
NME4-201ENST00000219479 GABBR2O75899 941 aa22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms